Dr. rer. nat. Thomas H. Schmidt

Geschäftsführer und Gesellschafter der Next Scientific GmbH
Bioinformatiker · Wissenschaftler · IT-Architekt

Ich verbinde wissenschaftliches Verständnis mit IT-Architektur und praktischer Umsetzung. Mein beruflicher Hintergrund reicht von computergestützter Forschung über wissenschaftliches Datenmanagement bis zur Entwicklung und zum Betrieb komplexer IT-Systeme.

Mit Next Scientific unterstütze ich Organisationen dabei, fachliche Anforderungen in tragfähige digitale Lösungen zu übersetzen. Dabei betrachte ich Anwendungen, Daten, Prozesse und Informationssicherheit im Zusammenhang.

Projektrolle

Fachliche Anforderungen verstehen. Technische Lösungen zusammenführen.

Bei digitalen Vorhaben müssen unterschiedliche Perspektiven zusammenkommen. Ich arbeite an der Schnittstelle zwischen Management, Fachbereich und IT und verbinde konzeptionelle Arbeit mit technischer Umsetzung.

Anforderungen
strukturieren

Ich kläre Ziele, Rahmenbedingungen und offene Fragen gemeinsam mit den Beteiligten. Daraus entsteht eine nachvollziehbare Grundlage für Umfang, Prioritäten und technische Entscheidungen.

Architekturen
entwickeln

Ich betrachte Anwendungen, Datenflüsse, Schnittstellen und Infrastruktur als zusammenhängendes System. Sicherheitsanforderungen und spätere Betriebsaufgaben fließen von Beginn an ein.

Umsetzung
begleiten

Ich verbinde Architekturarbeit mit praktischer Entwicklung und technischer Koordination. Dabei vermittle ich zwischen fachlichen Anforderungen, technischen Möglichkeiten und verfügbaren Ressourcen.

Weiterentwicklung
ermöglichen

Ich berücksichtige Dokumentation, Wartbarkeit und Übergabe bereits während der Umsetzung. So bleibt eine Lösung nicht nur für den ersten Einsatz, sondern auch für spätere Veränderungen handhabbar.

Werdegang

Erfahrung aus Wissenschaft, Entwicklung und IT-Betrieb.

Mein beruflicher Weg verbindet naturwissenschaftliche Forschung mit Softwareentwicklung, Datenmanagement und der Koordination anspruchsvoller IT-Umgebungen. Die folgenden Stationen geben einen Überblick über meine beruflichen Aufgaben und Verantwortungsbereiche.

Seit Juli 2022 · Next Scientific GmbH

Geschäftsführender Gesellschafter

Konzeption, Entwicklung und Umsetzung ganzheitlicher IT- und Datenmanagementlösungen für Healthcare, Medizin, Pharma und Life Sciences. Zu den Aufgaben gehören digitale Anwendungen, Datenplattformen und die Verbindung von Architektur, Entwicklung und Betrieb.

April 2021 – September 2023 · BwFuhrparkService GmbH

Application Manager Java/Mobile Applikationen, Fahrdienst Deutscher Bundestag

Koordination und Weiterentwicklung des IT-Betriebs für den Fahrdienst des Deutschen Bundestags. Teilprojektkoordination bei der Neuaufstellung der IT-Infrastruktur mit Schwerpunkten auf Informationssicherheit, hochverfügbaren Systemen, Automatisierung und Cloud-Service-Integration.

November 2018 – März 2021 · Deutsches Zentrum für Neurodegenerative Erkrankungen

IT- und Data-Management-Koordinator, Rheinland Studie

Koordination und Weiterentwicklung des IT-Betriebs der Rheinland Studie. Konzeption und Umsetzung von Infrastruktur- und Softwarelösungen, unter anderem für Hochleistungsrechnen, Studienanwendungen und die Integration von Labor- und Biomaterialsystemen. Mitarbeit am Datenschutzkonzept der Studie.

Januar 2017 – Oktober 2018 · Deutsches Zentrum für Neurodegenerative Erkrankungen

Software Engineer, Rheinland Studie

Entwicklung webbasierter Anwendungen und Datenbanken für Kontakt-, Studien-, Biomaterial-, Bildverarbeitungs- und Forschungsprozesse. Ergänzend Entwicklung von Automatisierungslösungen und Aufgaben in der Systemadministration.

Februar 2014 – April 2016 · Universität Bonn, LIMES-Institut

Wissenschaftlicher Mitarbeiter / Postdoc, Membranbiochemie

Moleküldynamiksimulationen zu neuronaler Kommunikation sowie Protein- und Lipidaggregation. Analyse großer Simulationsdatensätze und Entwicklung von Automatisierungsstrategien.

Oktober 2009 – August 2013 · Universität Bonn, Bonn-Aachen International Center for Information Technology

Wissenschaftlicher Mitarbeiter / Doktorand, computergestützte Strukturbiologie

Computergestützte Forschung zu bakteriellen Multiresistenzfaktoren. Entwicklung von Software zur automatisierten Einbettung dreidimensionaler Proteinstrukturen in Membranmodelle.

Januar 2009 – Mai 2022 · Nebenberufliche Selbstständigkeit

Software- und Webentwicklung, Webhosting und Beratung

Entwicklung von Komponenten und Erweiterungen für das Joomla!-CMS sowie individuelle Lösungen für Groupware, Hosting und Systemadministration.

August 2007 – Dezember 2008 · BASF AG, Polymerforschung

Ingenieur, Molecular Modeling

Moleküldynamiksimulationen zu hochverzweigten Polymeren und Mehrphasen-Grenzflächen. Entwicklung von Software zur Generierung und Analyse von Polymermodellen.

Ausbildung

Oktober 2009 – April 2014

Promotion in Molekularer Biomedizin

Universität Bonn

Dissertation

Computational Studies of the Escherichia coli Multidrug Efflux Pump AcrAB-TolC

In meiner Dissertation untersuchte ich mithilfe von Moleküldynamiksimulationen die bakterielle Effluxpumpe AcrAB-TolC. Dieser Proteinkomplex trägt zur Antibiotikaresistenz von Escherichia coli bei, indem er Wirkstoffe aus der Zelle transportiert. Im Mittelpunkt standen seine Struktur und Dynamik sowie die kritische Prüfung eines bestehenden Strukturmodells.

Ergänzend entwickelte ich zwei Softwarewerkzeuge, um die Einbettung von Membranproteinen in Simulationsmodelle zu verbessern und zu automatisieren.

Mehr erfahren

Oktober 2002 – Januar 2009

Studium der Bioinformatik

Fachhochschule Bingen

Diplomarbeit bei BASF AG, Ludwigshafen (Polymerforschung)

Entwicklung und Implementierung eines Reverse-Mapping-Algorithmus und Anwendung auf Polymersimulationen

August 2000 – Juni 2001

Ausbildung zum staatlich geprüften biologisch-technischen Assistenten (BTA) & Fachabitur in Biologietechnik

Adolf-Reichwein-Schule Marburg

Wissenschaftliche Veröffentlichungen

Google Scholar Profile | ResearchGate profile

Aziz A, Corman VM, Echterhoff AKC, Richter A, Schmandke A, Schmidt ML, Schmidt TH, De Vries F, Drosten C, Breteler M: Seroprevalence and Correlates of SARS-CoV-2 Neutralizing Antibodies: Results From a Population-Based Study in Bonn, Germany. Nature Communications (2021)

De Coninck D, Schmidt TH, Schloetel JG, Lang T: Packing Density of the Amyloid Precursor Protein in the Cell Membrane. Biophysical Journal 114, 1128-1141 (2018)

Schmidt TH, Homsi Y, Lang T: Oligomerization of the Tetraspanin CD81 Via the Flexibility of its δ-Loop. Biophysical Journal 110, 2463-2474 (2016)

Schmidt TH, Raunest M, Fischer N, Reith D, Kandt C: Computer Simulations Suggest a Direct and Stable Tip to Tip Interaction Between the Outer Membrane Channel TolC and the Isolated Docking Domain of the Multidrug RND Efflux Transporter AcrB. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes 1858, 1419-1426 (2016)

Batoulis H, Schmidt TH, Weber P, Schloetel JG, Lang T: Concentration Dependent Ion-Protein Interaction Patterns Underlying Protein Oligomerization Behaviours. Scientific Reports 6, 24131 (2016)

Destainville N, Schmidt TH, Lang T: Where Biology Meets Physics – A Converging View on Membrane Microdomain Dynamics. Current Topics in Membranes 77, 27-65 (2016)

Koch DC, Schmidt TH, Sahl H-G, Kubitscheck U, Kandt C: Structural Dynamics of the Cell Wall Precursor Lipid II in Presence and Absence of the Lantibiotic Nisin. BBA-Biomembranes 1838(12) 3061-3068 (2014)

Homsi Y, Schloetel J-G, Scheffer KD, Schmidt TH, Destainville N, Florin L, Lang T: The Extracellular δ-Domain is Essential for the Formation of CD81 Tetraspanin Webs; Biophysical Journal 107(1) 100-113 (2014)

Fischer N, Raunest M, Schmidt TH, Koch DC, Kandt C: Efflux Pump-Mediated Antibiotics Resistance: Insights From Computational Structural Biology; Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences 6(1) 1-12 (2014)

Schmidt TH, Kandt C: LAMBADA & InflateGRO2: Efficient Membrane Alignment and Insertion of Membrane Proteins for Molecular Dynamics Simulations; ACS Journal of Chemical Information and Modeling 52(10) 2657-2669 (2012)

Schmidt TH, O’Mara ML, Kandt C: Molecular Dynamics Simulations of Membrane Proteins: Building Starting Structures and Example Applications; Current Physical Chemistry 2(4) 363-378 (2012)

Lassen Sie uns Ihre fachlichen und technischen Anforderungen zusammenbringen.

Sie möchten ein digitales Vorhaben strukturieren, eine bestehende Lösung weiterentwickeln oder Architektur- und Sicherheitsfragen klären? In einem Erstgespräch besprechen wir Ihr Anliegen und mögliche nächste Schritte.

Erstgespräch vereinbaren

> Oder schreiben Sie uns eine Nachricht